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College of Biological Science and Engineering

洪曉昆

發(fā)布日期:2023-08-27 發(fā)布者:

姓名:洪曉昆

性別:

職稱:副研究員(校聘)/碩士生導(dǎo)師

學(xué)歷:博士研究生

電子郵件:hongxk@fzu.edu.cn

研究方向:生物信息學(xué)

研究生招生專業(yè)生物工程(學(xué)碩)、生物技術(shù)與工程(專碩)

教育工作經(jīng)歷:

20238-至今:beat365在線體育官網(wǎng) | beat365在線體育官網(wǎng)

20189-20236月:上海交通大學(xué) |系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院 | 生物學(xué) | 博士

20158-20186月:中山大學(xué) | 生命科學(xué)學(xué)院 | 動物學(xué) | 碩士

20119-20156月:beat365在線體育官網(wǎng) | beat365在線體育官網(wǎng) | 生物工程 | 本科

教學(xué)簡介:

科研簡介:

主要研究領(lǐng)域為蛋白質(zhì)翻譯后修飾的系統(tǒng)生物學(xué)研究,包括:1. 蛋白質(zhì)翻譯后修飾數(shù)據(jù)庫;2. 蛋白質(zhì)翻譯后修飾調(diào)控蛋白功能的計算解析;3.蛋白質(zhì)翻譯后修飾的人工智能預(yù)測方法。目前已在Bioinformatics、J Chem Inf Model、 Int J Biol Macromol和J Chem Theory Comput等生物學(xué)知名期刊發(fā)表SCI論文14篇(中科院1區(qū)3篇、中科院2區(qū)5篇),其中以第1作者發(fā)表論文6篇。授權(quán)2項發(fā)明專利和2項計算機(jī)軟件著作權(quán)。兼任福建省生物信息學(xué)會會員、上海市生物信息學(xué)會會員以及Briefings in Bioinformatics審稿人。

科研項目:

主持beat365在線體育官網(wǎng)科研啟動基金1項、測試基金1項;

參與國自然面上項目2項。

代表性論文:

1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823

2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618

3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233

4. Hong X#, Guo T#, Xu X*, Lin J*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552

5. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Dec;42(6):633-644

6. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212.


授權(quán)專利情況

1. 一種檢測路氏錐蟲的引物對和試劑盒。

2. 一種檢測小鼠錐蟲的引物對和試劑盒。


授權(quán)軟件著作權(quán)情況

1. 翻譯后修飾調(diào)控蛋白互作的數(shù)據(jù)查詢系統(tǒng)【簡稱:PTMint】。

2. 磷酸化修飾調(diào)控蛋白互作的人工智能預(yù)測系統(tǒng)【簡稱:PhosPPI】。

獲獎情況:

1. 上海交通大學(xué)優(yōu)秀畢業(yè)生

2. 碩士研究生國家獎學(xué)金

3. beat365在線體育官網(wǎng)本科生優(yōu)秀畢業(yè)設(shè)計(論文)